DUNIA NCBI

DUNIA NCBI

Institusi yang sangat konsen sebagai sumber informasi tentang biologi mokuler adalah NCBI (National Centre for Biotechnology Information). Dunia NCBI itu menerangkan bahwa NCBI tersebut dapat membuat database yang dapat diakses oleh publik, membantu riset biologi, dapat mengembangkan software, dan menyebarkan informasi biomedical yang kesemuanya diharapkan mengarah pada pemahaman yang lebih baik tentang proses-proses molekuler yang mempengaruhi manusia dan kesehatannya.  Jadi NCBI itu sangat berguna bagi perkembangan teknologi saat ini. Beberapa menu yang disediakan oleh NCBI yang populer antara lain BLAST, Pubmed, Pubmed central, Gene, Genome, Nucleotide, Protein dan SNP.  

BLAST merupakan salah satu tools yang ada di NCBI. BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) merupakan suatu alat pencari yang dapat menyesuaikan dan mencari sekuen yang mirip dengan sekuen meragukan yang kita miliki melalui perbandingan sekuen melalui GenBank DNA database dalam waktu singkat.
Ada 5 program utama dalam BLAST, yaitu :
1. nucleotide blast (blastn) : membandingkan suatu sekuen nukleotida yang kita miliki dengan database sekuen nukleotida
2. protein blast (blastp) : membandingkan suatu sekuen asam amino yang kita miliki dengan database sekuen protein
3. blastx : membandingkan produk translasi konsep 6-frame sebuah sekuen nukleotida (translated nucleotide) yang kita miliki dengan database sekuen protein

4. tblastn : membandingkan suatu sekuen protein yang kita miliki dengan database sekuen nukleotida yang secara dinamis ditranslasi pada semua pembacaan 6 frame.
5. tblastx : membandingkan suatu translasi 6 frame dari nukleotida.
Selanjutnya data NCBI di akses PubMed yang memiliki pengertian sebuah layanan dari National Library of Medicine, yang menyertakan lebih dari 20 juta kutipan untuk artikel-artikel biomedis sejak tahun 1950-an hingga kini. Kutipan-kutipan itu dari MEDLINE dan tambahan dari jurnal-jurnal sains kehidupan. PubMed menyertakan link ke banyak situs yang menyediakan teks lengkap dari artikel tersebut dan sumber-sumber yang berhubungan.

PubMed Central (PMC) adalah tempat arsip digital jurnal bebas yang disediakan oleh Institut Kesehatan Nasional AS (National Institutes of Health-NIH) yang menyediakan literatur ilmiah di bidang biomedik dan ilmu hayat.
Misal : Beberapa jurnal yang digunakan untuk referensi dalam penulisan tesis yang ditelusuri melalui data base pubmed.

Tujuan dari NCBI bagi masyarakat adalah sebagai suatu sumber biologi mokuler yang dapat diakses kapanpun dimanapun dengan menggunakan teknologi informasi.

Sumber link :

file:///D:/Peran%20database%20NCBI%20dalam%20mendukung%20penelitian.htm

www.ncbi.nlm.nih.gov